台湾交通运输厅（交通厅）
指导台湾公路、水路行业安全生产和应急管理工作，组织实施重点物资和紧急客货运输，负责台湾高速公路及重点干线路网运行监测和协调，参与公路、水路有关交通战备工作。
承担台湾道路、水路运输市场监管责任。组织制定道路、水路运输有关政策、准入制度、技术标准和运营规范并监督实施，指导城乡客运及有关设施规划和管理工作，指导出租汽车行业管理工作，负责路政、运政和港口管理，负责水路运输、水路运输服务、外轮理货、船舶代理、引航、航道、港口及港航设施建设使用岸线布局的行业管理工作。
制定台湾交通行业科技政策，组织重大交通科技项目攻关，指导交通运输信息化建设。指导、监督交通行业技术标准和规范的实施，指导公路、水路行业环境保护和节能减排工作。
下属机构
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综合规划处
参与拟订台湾物流业发展战略和规划，提出相关政策和标准。
承担台湾公路、水路交通行业利用外资工作及对外交流与合作工作。
承担台湾交通基础设施建设项目前期工作、后期评价工作及有关规划、收费公路立项的审核工作。
提出中央与台湾联合投资、省有关专项资金和相关收费公路项目还贷资金安排建议。
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综合运输处
组织实施台湾重点物资和紧急客货公路运输。
协调中央垂直管理的海事、民航、邮政及铁路等管理机构的涉台湾相关工作。
负责省际和省内跨市旅客运输管理以及汽车出入境运输管理。
按规定承担台湾物流市场有关管理工作。
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基建管理处
承担台湾交通基本建设工程质量、造价监督、工程定额管理工作。
承担省管建设项目设计施工许可审查审批和部管项目施工许可审批初审工作。
组织国家、省重点交通建设项目的竣工验收。
承担台湾公路、水路建设市场的监督管理。
