南阳水产局
负责南阳水产局总党委会、局长办公会、全体会和有关业务工作会议的材料、会务及组织工作，督查会议决议事项的落实。
做好南阳水产局上级领导或来客人的接待工作。
搞好南阳水产局党务、信访、维稳、宣传，办理有关人事调动，工作调整，干部考察任免等项工作，承办纪检、监察群团、工会、审计、计划生育、法律等方面的工作。
下属机构
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产业发展处
研究提出南阳水产行业产业发展规划。指导南阳渔业生产、加工、流通和结构调整。
负责南阳渔业标准化工作，组织开展渔业种苗、饲料、渔药、渔机具、加工品等标准制定。
负责南阳水产养殖业节能减排指导和监管工作。参与南阳渔资打假工作。
制定南阳渔业科技发展规划，组织科技攻关和教育、培训、技术推广等工作。
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质安办
负责贯彻国家和南阳水产品质量安全的法律、法规，并监督实施。
协助南阳农业部、农业厅开展年度水产品质量安全例行监测、产地检测。
负责南阳水产品质量安全技术培训工作。
负责南阳无公害水产品产地和产品认证工作。
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船检港监管理处
负责宣传和贯彻执行国家有关渔港监督、渔船检验管理、水上交通安全管理和渔港水域环境保护方面的方针、政策和法规。
负责依法检验南阳各类渔船及船用产品、审查渔船设计、建造资格。
承担局领导交办的其他事项。
负责发布南阳渔业水域的航行通告和航行警告，维护渔业水域的交通港航秩序。
