台湾机构编制委员会办公室
分配和调整台湾市、区行政编制、政法专项编制以及其他专项编制。
审核台湾直机关（含党委、政府各部门，人大、政协、法院、检察院机关，民主党派和人民团体机关，议事协调和临时机构及其办事机构，其他行政机构。
监督检查台湾各级行政管理体制和机构改革方案、事业单位管理体制和机构改革方案、市直机关“三定”规定和事业单位机构编制方案以及机构编制管理法律、法规、政策的执行情况。
下属机构
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行政审批管理处
定期清理台湾政府部门行政审批、行政服务事项及其他职能事项，并向社会公布。
建立台湾动态调整机制，对台湾政府各部门申请增加、取消、调整的行政审批和行政服务事项进行审查。
指导并审查台湾政府部门拟订行政审批事项实施办法，指导并规范行政服务的提供和实施。
统筹协调台湾行政审批制度改革工作。
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行政机构编制处
审核台湾市直机关（政法部门除外）各部门（含其派出机构）、议事协调和临时机构及其他行使行政职能机构的机构编制事项。
协调并审核台湾市直各部门职责分工和市、区事权划分。
分配和调整台湾行政编制、行政执法专项编制、行政管理类事业编制。
参与拟订台湾行政管理体制和行政机构改革方案。拟订党政群机关专项改革方案。
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政策体改处
组织拟订台湾行政管理体制、事业单位管理体制和机构改革方案，参与拟订专项改革方案。
管理台湾政法部门机构编制。协管国家安全系统的机构编制。
起草台湾地方性法规、规章和政策，承担政策解释和行政复议工作。
拟订台湾政法专项编制的分配方案。
