巴彦淖尔政府办公室
根据领导指示，组织协调处理突发事件和重大事故；
负责巴彦淖尔政府办公室的人事管理和思想政治工作；
起草、送审、印发以巴彦淖尔政府或巴彦淖尔政府办名义制发的文件，检查乡(镇)政府和巴彦淖尔直部门执行巴彦淖尔政府决定、指示、文件的情况，并负责向巴彦淖尔政府领导报告；
下属机构
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督办科
全国、省、巴彦淖尔政协委员提案及巴彦淖尔人大代表议案、建议和巴彦淖尔政协委员提案；
负责巴彦淖尔人大常委会、巴彦淖尔政协常委会例会应由巴彦淖尔政府办理的有关工作
督促检查上级党政机关转来的批示件、查办件的落实情况。
督促检查乡镇人民政府和巴彦淖尔政府各工作部门对巴彦淖尔政府重要工作部署的贯彻落实情况；
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秘书科
负责巴彦淖尔政府主要领导批阅文件的传递管理；
负责办理机构编制、审计、巴彦淖尔政府机关事务、发展改革、物价、粮食、能源、重点项目、轨道交通、财政、税务、金融、国有资产、国防动员、统计、工商管理、质量监督、食品药品监管、安全生产、文史、档案、地方志、行政服务中心、公共资源交易工作等方面的文电、会务、公务、督查和文稿起草工作；联系、协调分管副巴彦淖尔长分管联系单位的有关工作
负责巴彦淖尔政府及巴彦淖尔政府办公室往来各类文电及信件收发、分送、分办、转办及文件交换工作；
负责办理招商引资、工业、服务业、信息化、通信、科技、知识产权、地震、旅游、商贸、口岸、外事、侨务、港澳事务、对台工作、广州对口帮扶清远等方面的文电、会务、公务、督查和文稿起草工作；联系、协调分管副巴彦淖尔长分管联系单位的有关工作。
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信息科
根据巴彦淖尔政府工作重点和巴彦淖尔政府领导关注的热点、难点问题开展信息调研。
承办巴彦淖尔政府、巴彦淖尔政府办公室信息公开事务，指导、监督全巴彦淖尔政府信息公开工作；
协调组织巴彦淖尔政府有关活动的新闻报道；
指导、协调巴彦淖尔直单位电子政务工作，负责巴彦淖尔政府办公室信息系统建设、应用和管理工作；
